對于一些生產工藝單一，潔凈室分散，不能或不宜合為一個系統，或各個潔凈室無法布置輸送系統和機房等場合，應采用分散式潔凈空調系統 ，在該系統中把機房、輸送系統和潔凈室結合在一起，自成系統。在分散式潔凈空調系統中，在各個潔凈室或鄰室內就地安裝凈化和空調設備或凈化空調設備。 凈化空調設備可以是一個定型機組產品，它具有凈化功能，但處理的風量較少，往往不能滿足較高潔凈度的潔凈室所需風量，系統處理過程往往是一次回風系統。
由于凈化空調設備內風機要求克服熱交換盤管、通道及幾級過濾器的阻力，所需壓力很高。為了安裝于設備內，體積不可能很大；如采用較高轉數來達到所需壓力，噪聲震動又較大。國內設備狀況，這類機組發展較慢。眾所周知，潔凈室內除了一些必要設備外，盡可能把設備設置在室外，加上人員人數嚴格控制等，潔凈室的熱濕負荷通常比普通空調室小，但需風量卻比一般空調室大，這就從另一個角度限制了凈化空調設備的使用范圍。為了解決這一題，正分散式凈化空調系統中，可以將風機一過濾器單元等局部凈化設備放在潔凈室內，或設置于鄰室、套間，頂棚內等處而與潔凈室相聯。或利用鄰室、套間，頂棚等作靜壓箱，并在內設置普通空調機組，以作混風和空調處理用。它的處理過程可看作二次回風。 空調機組實際上是一個小型空調系統，它的冷源通常采用壓縮式制冷機組，熱源在容量不大和要求靈活性大時可采用電熱。空氣處理設備主要是制冷機的蒸發器，電加濕器及電加熱器。當潔凈室溫度，濕度全年的控制精度要求較高，可采用恒溫恒濕機組，它能自動調節空氣溫濕度，以維持室內一定溫度，濕度。當潔凈室僅要求夏季舒適性空調，即僅在夏季降溫去濕，可采用冷風機組。它與恒溫恒溫機組主要區別在于沒有自動控制（采用手動控制），電加濕器和電加熱器。如果是容量小的空調機組（冷量小于7kW,風量小于1200m³/h）可做成窗臺式。容量大的（冷量小于70kW，風量小于20000m³/h）為立柜式。
上述這種將空調和凈化兩種功能分開處理的作法，不僅解決潔凈室熱濕負荷小、處理風量大的難題，而且使系統更為靈活。由于利用套間或頂棚作靜壓箱，使空氣環路斷面大-輸送路線短，對空調機組和凈化設備的風機壓頭要求不高，因此相應噪聲與能耗也不高．凈化設備也可適應潔凈室需要，采用多種形式，與空調機組幾乎沒有關聯．這種形式在我國應用很廣泛。但是這種系統的新鳳往往只是靠套間或頂棚等產生負壓而滲透進來，不能有效控制，無法滿足室內衛生要求。潔凈空間內可通過送風量差值控制來建立正壓，但在套間中的負壓并不一定使室外新風通過新風過濾器進入套間，往往透過其他途經（從走廊及窗等）滲入，套間內濃度很不穩定．這樣不僅會影響過濾器使用期，而且也可能涉及到潔凈空間內的潔凈度，這是一個易被人忽視的問題。象上海城市建設學院的多功能潔凈實驗室，就在套間中增設了亞高效新風凈化機組。由于它配有可調風量風機，不僅可使套間
內保持正壓，穩定套間內空氣濃度；而且保證了潔凈空間內新風補給。 某些場合也可以用中效新風凈化機組。
全分散式凈化空調系統的最大特點就是靈活、簡易。它可滿足不同房間的不同送風要求。當室內熱濕負荷變化時，調節系統反應快，也不影響其他各室進風參數，潔凈空間小而單一，管理比較方便，潔凈度也易保證。加上沒有輸送管系及專用機房，節約了輸送能耗及沿途冷熱損失和污染，減少了輔助占地面積。另外空調機組體積小，現場安裝工作量少，操作使用也方便，不需要專門熟練操作工人。
客服1